خلاصه داستان فیلم ژن خوک درباره دو جوان که در زندان به سر می برند می باشد، دو زندانی به نام های رضا کیشمیش و عماد گربه که قصد فرار کردن از زندان را دارند، قصد آنها از فرار برای هدفی که از پیش تعیین شده است می باشد.

و در نهایت آنها فرار می کنند اما در این راه با اتفاقات مختلفی دست پنجه نرم می کنند، اما باز اوضاع اون جوری که فکر می کردند نمیشه و اتفاقات ناگواری براشون رقم می خوره، در واقع سوژه اصلی فیلم ژن خوک درباره آقازاده ها که این روزا با نام ژن خوک شناخته می شوند می باشد که در ادامه می بینیم که ژن های خوک و بچه های پایین شهر چه طور با هم کنار می آیند.