داستان فیلم در قلب ماشین در مورد کارگران داخل یک زندان در بلغارستان است، زمانی که کارگران در یک روز کاری در کارگاه زندان، در هنگام کار کردن یکی از زندانیان در داخل دستگاهی که با آن کار می کرد، یک کبوتر را می بیند و دستگاه را خاموش می کند و اصرار به در آوردن ان کبوتر از داخل ماشین می کند.

اما خارج کردن این کبوتر آنها را با اتفاقات عجیبی رو به رو می کند اتفاقاتی که منجر به کشته شدن چند تن از آنها می شود و در ادامه میبینیم که علت این کار برای چه بوده است…